Hola:
Nosotros nos vimos en la misma duda al comenzar nuestra casa. El PVC es más estanco y aisla más generalmente, por contra suele ser más caro y según el tipo, a la larga puede dar aspecto de "plástico viejo" al estar expuesto a intemperie. El aluminio resulta más barato generalmente y hay más variedad en colores, pero resulta menos estanco. Su durabilidad está garantizada sobre todo si es anodizado.
Particularmente me quedé con aluminio, y si te decides por estos, un consejo, que sea anodizado, con rotura de puente térmico y con cierre batiente u oscilobatiente, es lo más resistente, estanco, y aislante que encuentras. Colores tienes los que quieras, desde oscuros y clásicos (bronce, burdeos), hasta claros y modernos (natural, inox).
De las persianas, si te refieres a contraventanas del mismo material que las ventanas, es lo mejor que haces el ponerlas, pues además de la seguridad, obtienes mayor estanqueidad, mejor aislamiento (tanto térmico como sonoro), y la posibilidad de ventilar la casa aun cuando llueve, y con la seguridad de tener el hueco de ventana "cerrado". Te recomiendo igualmente las de lamas orientables, tienen una pequeña manivela que según la giras varía la orientación de esas lamas, pudiendo tenerla desce completamente cerrada (no entra absolutamente nada de luz) hasta totalmente horizontal, con lo que es similar a no tener las contraventanas, pero con la seguridad de este cierre adicional.
Saludos.