Tendrías que dar mas detalles, que tipo de desagüe, en un muro (para lavadora), en el piso, en un baño o terraza...etc.lo que explicas es muy general y no me imagino como es.Saludos.
Lo cortas un par de centímetros bajo el nivel del suelo, le aseguras cualquier tipo de tapón (que no se cuele el cemento ni salgan olores) y luego lo cubres con el cemento y el piso que le vayas a poner al armario.
Gracias Ignacio por tu respuesta, aunque en realidad no la entiendo muy bien. Supongo que me estás hablando como si fuera a quitar el plato de ducha, pero yo pretendo hacerlo encima, tapándolo.